Το κτίριο του Λιμεναρχείου Νεάπολης κατασκευάζεται σε οικοπεδική έκταση που βρίσκεται εντός του σχεδίου πόλης -με αποκλειστική χρήση από το Λιμεναρχείο-, την οποία παραχώρησε ο δήμος για τον σκοπό αυτό.
Το νέο διώροφο κτίριο Λιμεναρχείου, θα έχει δομημένη συνολική επιφάνεια 514,15 τετραγωνικά μέτρα και θα στεγάσει μαζί και το Δημοτικό Λιμενικό Ταμείο Μονεμβασίας, έχει συνολικό προϋπολογισμό 796.906,00 ευρώ. Χρηματοδοτείται από το Π.Δ.Ε. του Υπουργείου Ναυτιλίας και Νησιωτικής πολιτικής με αρχικό προϋπολογισμό 180.000 ευρώ, ενώ έχει εξασφαλιστεί για το 2021 και επιπλέον πίστωση 150.000 ευρώ.
Η συνολική μελέτη του κτιρίου, το οποίο πληροί τις προδιαγραφές βιοκλιματικού σχεδιασμού, έγινε από την Τεχνική υπηρεσία του Δήμου Μονεμβασίας, καθώς και η δημοπράτηση του έργου.